Mannequin à l'âge de douze ans, Elijah Wood fait sa première apparition à l'écran dans le clip I'm your girl de Paula Abdul. Au cinéma, il débute en jouant de petits rôles dans Retour vers le futur II (1989) de Robert Zemeckis et Affaires privées (1990) de Mike Figgis. Dans les années 90, Elijah Wood partage l'affiche avec des stars telles que Mel Gibson (Forever young de Steve Miner), Kevin Costner (A chacun sa guerre de Jon Avnet, un rôle qui lui vaut d'être nominé au YoungStar Awards en 1995), Bruce Willis (L'Irrésistible North de Rob Reiner) ou encore Kevin Kline (Ice storm d'Ang Lee).Il se voit également attribuer les rôles principaux des Aventures d'Huckleberry Finn (1993) de Stephen Sommers, Flipper (1996) d'Alan Shapiro et Deep impact (1998) de Mimi Leder. Le jeune acteur négocie le tournant de l'adolescence en interprétant un élève aux prises avec des extraterrestres dans The Faculty (1998) de Robert Rodriguez. Mais c'est en 2001, avec son personnage de Frodon Sacquet le hobbit dans la trilogie du Seigneur des anneaux de Peter Jackson, que son visage devient véritablement familier pour le grand public. Malgré son statut de star, Elijah Wood fait preuve d'humilité en enchaînant avec un second rôle, celui d'un technicien chargé d'effacer les souvenirs de Jim Carrey dans Eternal sunshine of the spotless mind (2004) de Michel Gondry.