Chargé du story board sur les séries Armor Hunter Mellow link en 1988 et Mobile suit gundam 0083 : Stradust memory en 1991, Shinichiro Watanabe devient co-réalisateur de Macross Plus trois ans plus tard, puis dévellope la série Cowboy Bebop. Le succès de la série, diffusé en 2001 sur Canal + en France, lui apporte la reconnaissance internationale. En 1999, Shinichiro Watanabe s'attaque à la réalisation de Cowboy Bebop tiré de la série animée, avant de participer à l'aventure The Animatrix en réalisant deux épisodes : A kid story et A detective story, dont il signe également le scénario.