En 1989, Lou Ye obtient un diplôme de réalisateur à l'académie du film de Beijing. Il tourne ensuite plusieurs courts métrages. En 1994, il réalise son premier long métrage, Weekend lover. Le film remporte le prix Fassbinder du meilleur réalisateur au festival de Mannheim-Heidelberg en 1996. Lou Ye y montre un Shanghai dans lequel déambule une jeunesse sans repères, ce qui lui cause quelques problèmes avec la censure.Deux ans plus tard, Lou Ye écrit, co-produit et réalise Suzhou River, histoire d'amour fantastique revisitant le mythe occidental de la sirène. Ce deuxième long métrage le révèle et obtient le grand prix du festival de Rotterdam, ainsi que le grand prix et le prix d'interprétation féminine au festival de Paris en 2000. En 2003, le cinéaste écrit et réalise Purple Butterfly, dans lequel il revient sur le conflit sino-japonnais dans les années 30. Le film fait partie de la sélection officielle du festival de Cannes en 2003.