Née en 1962 à Paris, Isabelle Czajka sort à 21 ans de l'École Nationale Louis Lumière et se dirige vers les métiers de l'image. Elle travaille alors plusieurs années comme assistante puis cadreuse et chef opératrice sur des longs-métrages et des documentaires.
En 1998 elle réalise un documentaire dans le cadre des Ateliers Varan : Tout à inventer (l'angoisse d'une mère face à son bébé), puis en 2001, un court-métrage : La cible (une femme, intérimaire, passe un test de consommation dans un centre commercial), primé au festival de Clermont-Ferrand.
L'année suivante est son premier long-métrage. Le film a reçu le Léopard de la première oeuvre au Festival de Locarno.