Une secte ufologique découvre un vaisseau spatial extraterrestre échoué sur Terre. Le FBI envoie un agent infiltrer la secte mais ce dernier en devient un membre et a pour mission de tuer l’enfant de Scully. Pendant ce temps, Scully prend enfin conscience des étranges pouvoirs de son enfant William et réalise qu’il est en grand danger lorsqu’elle lui sauve la vie de justesse. Elle est obligée de prendre des mesures radicales pour le sauver et décide de le confier aux Bandits Solitaires pendant qu’elle mène l’enquête avec Reyes…
Titre original de l'épisode : Provenance
Titre de la série : X-Files : aux frontières du réel